Собор во имя Преображения Господня Спасского монастыря строился с 1638 по 1643 год. Храм стал первым каменным собором Арзамаса.
Собор Спасо-Преображения первой половины 17 века отреставрировали в Арзамасе. Подрядчик привел в порядок фасады, кровлю, интерьеры и подготовил стены памятника архитектуры под роспись. Рабочие укрепили стены, обустроили отмостку, водосток, гидроизоляцию, восстановили цоколь, крыльцо и полы. Также были заменены окна, двери и выполнена окраска куполов. Об этом сообщает pravda-nn.ru со ссылкой на УГООКН по Нижегородской области.
Во второй половине 18 века храм сильно видоизменился. С западной стороны к церкви пристроили обширную трапезную с крыльцом и папертью. После Октябрьской революции 1917 года все здания монастыря передали местной власти, церкви опечатали. 11 сентября 1925 года Спасо-Преображенский собор стали использовать под военные склады, позже в храме разместили уездный архив. В 2015 году архив выехал из здания, а собор передали РПЦ.